在终止部分重配置过程后，我可以直接断言nConfig信号吗？

是的，您可以在终止部分重配置过程后直接断言nConfig信号。
但是，您应该确保在断言nConfig之前再切换PR_CLK 20个时钟周期，以刷新PR_CONTROL_BLOCK并避免锁定。